Aminosyror
Aminosyror är små molekyler (jämfört med proteiner) som alltid har en syra (karboxylgrupp) i ena änden och en bas (amingrupp) i andra änden.
Strukturen hos en karboxylgrupp.
Strukturen hos en amin.
Det finns hundratals aminosyror observerade på jorden, men hos däggdjur är det 20 stycken aminosyror som bygger upp alla proteiner.
Tabell över aminosyror
| Förkortning | Namn |
|---|---|
| Ala | Alanin |
| Cys | Cystein |
| Asp | Asparaginsyra |
| Glu | Glutaminsyra |
| Phe | Fenylalanin |
| Gly | Glycin |
| His | Histidin |
| Ile | Isoleucin |
| Lys | Lysin |
| Leu | Leucin |
| Met | Metionin |
| Asn | Asparagin |
| Pro | Prolin |
| Gln | Glutamin |
| Arg | Arginin |
| Ser | Serin |
| Thr | Treonin |
| Val | Valin |
| Trp | Tryptofan |
| Tyr | Tyrosin |
Glutamin är en av de vanligaste aminosyrorna i kroppen. Var är karboxylgrupp och amingrupp?
Peptider
Aminosyror kan binda till varandra genom peptidbindningar, vilket är en bindning mellan den basiska och sura änden av aminosyrorna. Molekylen som bildas kallas för en peptid.
- Två aminosyror - dipeptid
- Tre aminosyror - tripeptid
- Fyra aminosyror - tetrapeptid
- Fler än tre aminosyror färre än tjugo - oligopeptid
- Fler än tjugo aminosyror - polypeptid
Peptider består av 50 eller mindre aminosyror är det fler är det istället ett protein.
*En tripeptid, tre aminosyror bundna till varandra. I exemplet ovan Val-Gly-Ala.
Protein
Aminosyror kan bygga upp oerhört långa kedjor och är det över 50 stycken aminosyror bildar de ett protein.
Proteinstruktur
Vilket protein som bildas beror på vilka och ordningen på aminosyrorna, men inte bara - även form och struktur påverkar. Detta brukar delas upp i nivåer av strukturer.
Primärstruktur
- vilka, och i vilken ordning aminosyrorna bygger upp proteinet.
Aminosyror bygger upp ett protein i en viss ordning
Sekundärstruktur
- hur strukturen hos proteinet ser ut, och vilken form det har.
- de olika formerna ges av vätebindningar mellan de olika peptidkedjorna och resulterar i spiraler, veckningar etc.
Trots samma ordning kan proteiner skilja sig åt genom form och struktur.
Tertiärstruktur
- hur sekundärstrukturerna i en polypeptidkedja i proteinet förhåller sig till varandra
- kan ses som hur sekundärstruktur förhåller sig till varandra
Kvartiärstruktur
- om proteinet består av flera polypeptidkedjor beskrivs deras tredimensionella struktur
- kan ses som den övergripande strukturen hos proteinet
Bild från National Human Genome Research Institute.
Form och struktur spelar roll
Vilken av proteinerna kommer passa i receptorn?
En av alla viktiga funktioner proteiner har är bland annat att agera signalsubstans, det vill säga skicka signaler för att reglera processer i celler.
För att det ska fungera måste de passa den receptor som tar mot meddelandet.
Proteiners olika funktioner
Strukturproteiner
Enzymer / reglerande proteiner
Transportproteiner
Försvarsproteiner
Mer om protein
Prostetisk grupp
Co-enzym
Co-faktor